ブータンの国土は標高200m前後の南部インド国境地帯から7,000m以上の北部山岳地帯まであり、土地毎にその風土も大きく異なります。実際に観光客が主に訪れるのは国土の半分以上にあたる標高1,500〜3,000m前後の地域です。
ブータンには明確な四季があり、大きく分けると６月末〜９月上旬が雨季、９月中旬〜５月が乾季です。緯度は奄美大島とほぼ同じですが、標高が高いため紫外線が強く、朝夕の寒暖差が激しいのが特徴。年間通じて重ね着がおすすめ。乾燥対策も必須です。
一般的にベストシーズンは春・秋と言われていますが、季節毎の魅力があるのでご旅行の目的に合わせ時期を選びましょう。

春（3月下〜6月中）

寒さも和らぎ、気候の安定する季節。3月に入ると木々が芽吹き、杏の花が咲き始め、4月にはりんごの花が咲く。4月下旬〜5月上旬は標高3,000m付近でシャクナゲ、ツツジなどの花が咲き乱れる。パロ周辺では5月末〜6月中旬頃が田植えの季節となる。

夏（6月下〜9月上）

緑美しい季節。7〜8月を中心に雨季。7月頃は高地でブルーポピーなどの高山植物が見頃を迎え、8〜9月は、ブムタン地方でソバのピンクの花が咲く。西ブータンの稲作地帯は棚田が一面緑となり、北部に住む遊牧民はヤクを連れ4,000m以上の高原へ放牧へでかける。

秋（９月中〜11月中）

晴天が多くとても美しい季節。峠からブータン・ヒマラヤの展望が楽しめ、トレッキングには絶好のシーズン。ブムタン地方では９月後半からソバの収穫、パロ周辺では10月頃から米の収穫が始まる。屋根に収穫を終えた唐辛子が干される様は季節の風物詩となっている。

冬（11月下〜３月中）

空気、川の水が澄み、峠からのヒマラヤや星がとても綺麗な季節。農閑期のため、人も町ものんびりとした雰囲気になる。極寒のイメージがあるが、峠など3,000m以上を越える場所をのぞけば積雪はほぼなく、日差しは強烈なのでパロ、ティンプーでも日中は10度近くまで気温がアアガル。標高の低いプナカやウォンディフォダンでは、最高気温が15度前後まで上がり暖かく感じるほど。但し、夜間は氷点下まで冷え込むことも。また峠では雪や凍結のため一時的に道路が通行できなくなることもある。